农村合作医疗（新农合）和医疗保险（职工医保、居民医保）各有其优势和适用人群，具体哪个更好取决于个人的实际情况和需求。以下是它们之间的主要区别：
覆盖对象
合作医疗：主要针对农村户口的居民，特别是新型农村合作医疗，报销范围通常限于乡镇卫生院，且起付线较低，城市医院的报销比例较少。
医疗保险：包括城镇职工基本医疗保险和城镇居民基本医疗保险，覆盖城镇所有用人单位及其职工，以及没有参加城镇职工医保的城镇未成年人和没有工作的居民。其报销范围更广，包括药店购药和住院治疗等，且在大医院的报销比例较高。
缴费与保障
合作医疗：缴费主体包括农民个人、集体和政府，通常是一年一缴，保障期限为一年。
医疗保险：缴费主体主要是劳动者和用人单位，通过双方共同缴费提供保障，一般要求持续缴纳最少15年才可以享受终身医保待遇。
报销比例与限额
合作医疗：报销比例较低，且限额也较低，这是因为其筹资水平和保障能力有限。
医疗保险：报销比例较高，且限额更高，在面临高额医疗费用时，医疗保险能提供更有力的保障。
长期保障
合作医疗：通常没有终身保障的概念，需要每年缴费才可以享受保障。
医疗保险：对于职工医保而言，缴满一定年限（如20年）后，参保人可以享受终身医保待遇。
服务质量
医疗保险：服务质量相对较高，因为医保是由国家统一管理的，医疗机构也都是经过认证的。
合作医疗：服务质量可能相对较低，且受限于其覆盖范围和报销能力。
建议
如果是农村居民，经济条件一般，建议选择新农合，因为它缴费较低，且能提供一定的医疗保障，特别是在乡镇卫生院就诊时报销比例较高。
如果是城镇居民，经济条件较好，建议选择医保，因为它覆盖范围更广，报销比例更高，且可以享受终身保障。
如果条件允许，也可以考虑购买商业医疗保险，以获得更全面的保障。
综上所述，合作医疗和医疗保险各有其优势，选择哪个更好应根据个人的户口性质、工作状况、经济状况以及医疗需求等因素进行综合考虑。