调解纠纷可以选择以下部门：
人民调解委员会：
这是依法设立的调解民间纠纷的群众性组织，具有调解合同纠纷的职能。当事人可以向当地人民调解委员会申请调解，由调解员在查明事实、分清是非的基础上，根据自愿、合法的原则进行调解。调解达成的协议具有法律约束力，双方应当履行。
仲裁机构：
如果和解和调解均无法达成一致，当事人可以根据仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。仲裁具有一裁终局的特点，且仲裁裁决具有法律效力，可以强制执行。根据《仲裁法》的相关规定，仲裁庭在作出裁决前，也可以先行调解，当事人自愿调解的，仲裁庭应当调解。
行政调解职能部门：
例如卫生健康、公安、市场监管、民政、住房和城乡建设、自然资源、生态环境、交通运输、城市管理等部门，这些部门在其职责范围内可以进行行政调解。
人民法院：
当其他调解途径无法解决纠纷时，当事人可以向人民法院提起民事诉讼。法院调解是人民法院主持下进行的调解，属于诉内调解。
行业性专业性调解组织：
例如医疗纠纷调解委员会，可以专门调解特定类型的纠纷。
多元调处化解中心：
如克拉玛依区社会矛盾纠纷多元调处化解中心，整合了信访、司法、劳动仲裁、劳动监察、市场监管局、法院、公证、民政、退役军人事务局等多个单位，实现调解力量多元化以及人民调解、行政调解、司法调解的“三调联动”。
建议根据纠纷的性质和具体情况选择合适的调解部门。如果纠纷涉及合同，可以先尝试向人民调解委员会或仲裁机构申请调解。如果纠纷涉及行政违法行为，可以向相关行政调解职能部门投诉。若纠纷涉及民事权益，且其他调解途径无效，可以向人民法院提起诉讼。