电商企业纳税的方法如下：
一般纳税人有限公司
需要按照13%的税率缴纳增值税。
需要缴纳25%的企业所得税。
可能享受地方政府的扶持政策，例如增值税和企业所得税的返还，最高可达90%，最低为70%。
小规模纳税人个体户
通常按照5%-35%的税率缴纳个人经营所得税。
可以申请核定政策，核定后的个税按照0.3%-1%的税率缴纳，综合税率在2%左右。
增值税
电子商务如果有增值税交易，需要缴纳增值税。小规模纳税人负担4%，一般纳税人负担17%，但可以抵扣进项税。
城市维护建设税、教育费附加
基于应缴纳的增值税和营业税之和，分别乘以7%和3%。
个人所得税
分为股东分红个税和员工工资薪金个税，前者为20%，后者适用七级超额累计税率3%-45%。
企业所得税
根据企业年利润计算，不超过300万元的部分按5%征收，超过300万元的部分按25%征收。
其他税费
包括印花税、残保金等。
建议
了解当地政策：不同地区的税务政策有所不同，建议电商企业详细了解并遵守当地的税法法规。
规范账务管理：建立专业账户，及时记录所有销售订单和采购订单的交易流水，以便于查账和报税。
准确申报税款：根据税务机关的要求，准确填写税务申报表和相关申报材料，确保账目清晰准确，避免税务风险。
通过以上方法，电商企业可以合法合规地进行纳税，降低税务成本，确保企业的健康发展。