有凭证的借条想要消除，可以采取以下几种方法：
还清借款
当借款已经还清之后，借条自然就可以消除。这需要借款人和出借人双方进行充分的协商，并在达成一致后，由借款人归还借款，出借人确认收款后，借条即被视为消除。
双方协商消除
如果借贷关系不存在或双方同意消除借条，也可以进行协商并签署一份消除协议。这份协议应当明确双方的权利和义务，以及借条消除的具体事项。
收集其他证据
如果借条仍然存在，但借款人已经还清借款，出借人可以收集其他能够证明借款事实已经消除的证据，例如还款记录、收据、银行转账记录、见证人证言等，以证明借款关系已经结束。
法律途径
如果对方拒不承认借款或拒绝消除借条，出借人可以通过法律途径解决纠纷。例如，可以向法院提起诉讼，要求确认借款关系已经消除，并提供相关证据证明借款已经还清。
作废或删除凭证
如果借条是作为会计凭证的一部分，可以通过作废或删除该凭证来消除。具体操作步骤可能因使用的财务软件而异，例如在金蝶或用友系统中，可以选择要作废的凭证，然后通过相应的菜单进行作废或删除操作。
建议
保留证据：无论采取何种方式消除借条，都应确保保存好所有相关证据，以便在出现争议时能够维护自己的合法权益。
协商一致：在消除借条时，务必确保双方充分协商并达成一致，避免后续产生不必要的纠纷。
法律咨询：在处理此类问题时，建议咨询专业律师，以确保自己的行为合法合规，并最大限度地保护自己的权益。