药店主要交纳的税种包括以下几种：
增值税：
药店销售药品属于应税销售行为，需要缴纳增值税。根据经营规模和是否是一般纳税人，税率有所不同，小规模纳税人税率为3%，一般纳税人税率为17%。
消费税：
如果药店销售的药品属于应税消费品，那么还需要缴纳消费税。消费税是针对特定消费品在消费环节征收的税，具体税率取决于药品类型和国家的税收政策。
企业所得税：
药店作为企业，盈利后需要按照企业所得税的规定交税。企业所得税是对企业经营所得收入在扣除成本、费用、损失后形成的净利润进行征税。根据企业的规模，税率有所不同，一般企业所得税率为25%，符合条件的小型微利企业可能会享受更低的税率。
个人所得税：
药店中的个人收入，如工资、奖金等，达到一定标准后也需要缴纳个人所得税。个人所得税是对个人收入进行的一种税收，以确保公平性和平衡社会财富分配。
城市维护建设税：
这是一种地方税，主要用于城市维护和建设。药店的销售收入达到一定标准后，需要缴纳城市维护建设税。具体的税率会根据所在城市的规模和政策有所不同，一般城市税率为7%，县城、镇为5%，乡村为1%。
教育费附加税：
这是根据国家有关法律规定，按照增值税和消费税的应纳税额来征收的一种附加税费，用于支持教育事业的发展。药店作为销售应税商品的场所，也需要缴纳教育费附加税。
地方教育费附加：
这也是根据增值税和消费税的应纳税额征收的附加税费，税率通常为2%。
印花税：
如果药店签订合同，需要缴纳印花税。例如，租赁房屋合同印花税率为0.1%，购销合同印花税率为万分之五。
房产税：
如果企业拥有房产产权，需缴纳房产税。房产税是在城市、县城、建制镇、工矿区范围内，对拥有房屋产权的内资单位和个人按照房产税原值或租金收入征收的一种税。税率一般为1.2%。
土地使用税：
根据土地使用情况，药店可能需要缴纳土地使用税。
以上是药店需要交纳的主要税种及其税率。具体税率和应纳税额应根据药店的实际情况和当地税务部门的规定来确定。建议药店在经营过程中咨询专业的税务顾问，以确保合法合规经营。