商铺过户费的计算涉及多个方面，包括契税、增值税、个人所得税、营业税、土地增值税、工本费、手续费和其他相关费用。具体计算方式如下：
契税
契税的税率为3%，计算基础是产权转让价格。
增值税
对于个人购买且已满两年的商业产权转让，需缴纳差额除以1.05后再乘以5.6%作为增值税。
对于不满两年的商业产权转让，需要将前述公式中的“差额”替换为“全额”，再进行相同的计算。
个人所得税（个税）
根据成交价的1%来计算个税。如果以公司名义转让，则个税需要缴纳成交价的20%。
营业税
营业税的税率为差额的5.55%。
土地增值税
需要缴纳成交价的1%作为土地增值税。
工本费
工本费大约为200元，用于过户手续的办理。
手续费
按照每平方米8元计算。
其他费用
包括查档费、评估费、抵押公证费、按揭合同工本费、商品房案值评估费等，具体费用可参考相关条款。
综合计算示例
假设商铺的成交价为100万元，以下是各项费用的计算：
契税 ：100万元 × 3% = 3万元增值税
（100万元 - 原价）× 5.6%
个人所得税
100万元 × 1% = 1万元（个人）
或 100万元 × 20% = 20万元（公司）
营业税
（100万元 - 原价）× 5.55%
土地增值税：
100万元 × 1% = 1万元
工本费：
200元
手续费：
100平方米 × 8元/平方米 = 800元
建议
具体税费的计算可能受到地区和政策的影响，不同地区可能存在差异。建议在办理商铺过户手续前，咨询当地房地产交易管理部门或专业律师，以确保准确了解和遵守相关税费规定。